巴拿马运河扩建工程竣工启用后，已有十八艘新巴拿马级货柜船（neopanamax）通过运河，而八月份已有一百五十六艘新巴拿籍货船预约通行。墨西哥全国进出口协会指出，扩建后的巴拿马运河将可为太平洋地区出口至欧洲的企业，以及位于墨东部地区向亚洲、南美洲出口企业带来利益，让墨西哥进出口企业运费节省三成。也有业界认为，扩大巴拿马运河可能将使运费暴跌，出现更激烈的市场竞争。

巴拿马运河管理局估计，自明2017年开始，运河扩建工程将为巴拿马财政部每年贡献4-4.5亿美元的额外收入，而在今年预计将可上缴国库10.6亿美元收入，2021年更可增至约20亿美元。

墨西哥是巴拿马运河第八大用户，以往墨西哥东部的业者出口产品到香港，需要支付600美元陆地运输费用，将货物运至太平洋港口后，再另付600美元航运费，现在通过巴拿马运河运往香港，仅需800美元海运费。

由于新巴拿马运河不再受限于「巴拿马极限」，货柜船运力将从4000至5000TEU提高到13000TEU，预计每年将有17000万艘船隻从运河通过，货物年通过量也将从3亿吨，增加到6亿吨。

巴拿马运河管理局统计显示，2015年来自或前往中国大陆的货运量，佔当年运河全部通过量的二成左右，已成为仅次于美国的运河第二大用户，中国船运企业每年要向巴拿马政府缴纳上亿美元的「过路费」。